Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc69Q3TCJ8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc69Q3TCJ8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms