Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms