Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms