Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms