Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tgm3Q08189 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms