Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cab39Q06138 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms