Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms