Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snai1Q02085 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms