Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ascl1Q02067 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl1Q02067 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms