Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms