Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms