Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Grin2cQ01098 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grin2cQ01098 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grin2cQ01098 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grin2cQ01098 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grin2cQ01098 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grin2cQ01098 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grin2cQ01098 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grin2cQ01098 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grin2cQ01098 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grin2cQ01098 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Grin2cQ01098 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Grin2cQ01098 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grin2cQ01098 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grin2cQ01098 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grin2cQ01098 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Grin2cQ01098 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grin2cQ01098 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms