Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serpina1cQ00896 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serpina1cQ00896 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serpina1cQ00896 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serpina1cQ00896 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serpina1cQ00896 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serpina1cQ00896 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serpina1cQ00896 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serpina1cQ00896 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serpina1cQ00896 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serpina1cQ00896 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serpina1cQ00896 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serpina1cQ00896 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serpina1cQ00896 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Serpina1cQ00896 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serpina1cQ00896 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serpina1cQ00896 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serpina1cQ00896 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serpina1cQ00896 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serpina1cQ00896 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serpina1cQ00896 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Serpina1cQ00896 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms