Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms