Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pkp1P97350 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms