Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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