Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gbx1P82976 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms