Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nucb2P81117 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nucb2P81117 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms