Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabpb2P81069 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms