Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx1P81068 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms