Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp9xP70398 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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