Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chl1P70232 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chl1P70232 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chl1P70232 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chl1P70232 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms