Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gabra1P62812 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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