Protein–RNA interactions for Protein: P62334

Psmc6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc6P62334 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc6P62334 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms