Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms