Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm2P58774 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms