Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Paxbp1P58501 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Paxbp1P58501 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms