Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PctpP53808 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PctpP53808 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms