Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SqleP52019 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SqleP52019 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SqleP52019 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SqleP52019 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SqleP52019 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SqleP52019 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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