Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CcnfP51944 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CcnfP51944 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CcnfP51944 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CcnfP51944 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CcnfP51944 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CcnfP51944 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CcnfP51944 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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