Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psen1P49769 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Psen1P49769 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms