Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpreP49446 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpreP49446 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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