Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb42P49222 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb42P49222 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms