Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms