Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl11P48298 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms