Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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