Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ThpoP40226 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ThpoP40226 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ThpoP40226 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ThpoP40226 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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