Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprkP35822 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprkP35822 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprkP35822 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprkP35822 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprkP35822 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprkP35822 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprkP35822 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprkP35822 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprkP35822 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprkP35822 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprkP35822 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms