Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp4P35123 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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