Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccnd3P30282 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccnd3P30282 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms