Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RxrgP28705 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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