Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col2a1P28481 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col2a1P28481 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms