Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BrafP28028 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BrafP28028 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BrafP28028 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BrafP28028 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BrafP28028 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BrafP28028 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BrafP28028 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BrafP28028 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BrafP28028 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BrafP28028 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BrafP28028 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BrafP28028 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BrafP28028 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BrafP28028 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms