Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U2af2P26369 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U2af2P26369 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U2af2P26369 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
U2af2P26369 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
U2af2P26369 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U2af2P26369 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms