Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CftrP26361 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CftrP26361 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CftrP26361 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CftrP26361 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CftrP26361 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CftrP26361 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CftrP26361 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CftrP26361 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CftrP26361 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CftrP26361 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CftrP26361 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CftrP26361 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CftrP26361 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CftrP26361 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CftrP26361 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CftrP26361 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CftrP26361 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CftrP26361 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CftrP26361 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CftrP26361 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CftrP26361 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CftrP26361 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CftrP26361 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CftrP26361 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CftrP26361 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CftrP26361 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CftrP26361 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CftrP26361 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CftrP26361 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CftrP26361 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CftrP26361 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CftrP26361 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CftrP26361 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CftrP26361 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CftrP26361 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CftrP26361 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CftrP26361 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CftrP26361 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CftrP26361 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CftrP26361 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CftrP26361 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CftrP26361 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CftrP26361 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CftrP26361 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CftrP26361 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CftrP26361 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CftrP26361 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CftrP26361 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CftrP26361 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CftrP26361 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CftrP26361 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CftrP26361 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CftrP26361 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms