Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NelfeP19426 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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