Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl13aP19253 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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