Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18526 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18526 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18526 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms