Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcnaP17918 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcnaP17918 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PcnaP17918 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PcnaP17918 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms