Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

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Length 1,069 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp53P15975 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp53P15975 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp53P15975 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp53P15975 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp53P15975 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp53P15975 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp53P15975 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp53P15975 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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